Репортер по имени Сакаи и фотограф Джанко снимают крушение, вызванное ураганом. Позже в этот же день гигантское яйцо найдено на берегу. Местные сельские жители спасают его, и приезжают ученые, чтобы изучить яйцо. В то время как Сакаи и Джанко пытаются задать вопросы Профессору Миеры о яйце, предприниматель Камаяма прогоняет ученых, и объясняет, что он купил яйцо у местных сельских жителей. Вместо того, чтобы позволить ученым изучить яйцо, Камаяма хочет превратить его в большую достопримечательность. Сакаи, Джанко, и Профессор Миера недовольны и полагают, что Камаяма не имеет никакого права держать яйцо. В то же время как эти трое говорят о яйце в гостинице, они обнаруживают сдачу багажа Камаямы. Сакаи задается громким вопросом, может ли кто - то еще работать с Камаямой. Камаяма идет в комнату г. Торахаты, главы Предприятия. Они обсуждают миллиард долларов за достопримечательность, двух крошечных близняшек, известных как Феи, посещают их. Феи объясняют, что они прибыли с "Острова Мотры", и что яйцо принадлежит монстру по имени Мотра. Торахата и Камаяма игнорируют девочек, умоляющих их. Феи уходят из комнаты и встречаются с Сакаи, Джанко и Профессором Миеры около гостиницы. Девочки просят их вернуть яйцо и эти трое обещают сделать все, что они могут, чтобы вернуть яйцо на Остров Мотры. Девочки объясняют, что если яйцо не вернуть, родится личинка и разрушит все вокруг. Девочки уезжают и даже при том, что они не смогли вернуть яйцо, они благодарят Сакаи, Джанко и Миеру за их доброту. В то время как эти трое проверяют на радиоактивность индустриальную область, внезапно появляется Годзилла и начинает нападать на ближайшие города. Редактор газеты, в которой работает Сакаи, думает, что вооруженные силы не смогут сделать ничего с Годзиллой и обсуждает это с Сакаи и Джанко. Джиро, другой репортер, который любит есть яйца, входит и предлагает, что Мотра могла бы победить Годзиллу. Сакаи и Джанко скептики, потому что островитяне не согласятся, потому что атомное испытание разрушило большую часть их острова, и они не смогут возвратить яйцо им. Эти двое идут на Остров Мотры с Профессором Миерой. Они захвачены местными сельскими жителями и принесены руководителю племени. Эти трое просят о помощи, но, как и ожидалось, не соглашаются из-за атомного испытания, которое разрушило их остров, и отказа японцев возвратить яйцо. Слышатся поющие феи, и все идут к ним. Сакаи, Джанко, и Миера спрашивают у фей помощь Мотры, но они также не согласны. Джанко умоляет сельских жителей, что не все Японцы виновны в том, что случилось с их островом. Годзилла убивает всех, и ничто не может спасти их страну, Сакаи добавляет, что "мы - все люди", и что все должны помогать друг другу. Вскоре слышится визг Мотры, и Феи просят, чтобы все следовали за ними. Они убеждают Мотру помочь Людям, но монстр слаб. После того, как монстр сразится с Годзиллой, она не сможет возвратиться к острову.
На следующий день, Камаяма наталкивается на комнату Торахата и требует Торахата, чтобы тот дал ему его деньги назад, которые Торахата недавно обманом взял у Камаямы. Эти двое сходятся в кулачной драке, и Камаяма сбивает Торахата. Камаяма вползает в кабинет Торахата и крадет его деньги. Торахата пробуждается и видит, что Годзилла приближается к гостинице. Он тогда захватывает оружие и убивает Камаяму. Торахата пробует убежать с его деньгами, но монстр разрушает гостиницу. Годзилла идет к яйцу и пытается разрушить его, пока не появляется Мотра. Они борются, и Мотра, кажется, побеждает. Но Годзилла запускает свой тепловой луч в Мотру и убивает ее. Мотра умирает. Годзилла уходит. Феи тогда объясняют Сакаи, Джанко и Миере, что яйцо разлепится сегодня. Крошечные близнецы вскоре начинают петь. Тем временем, вооруженные силы пытаются бороться с Годзиллой, используя электричество. Феи продолжают петь, и яйцо монстра, наконец, рождает не одну, а две личинки Мотры. Личинки Мотры следуют за Годзиллой к Острову Ивы и используют паутину против Годзиллы, чтобы обернуть гигантского монстра в кокон. Годзилла борется, но он становится полностью обернутым и погружается в океан. Личинки Мотры празднуют победу и возвращаются на свой остров.