Мазахико и Кейзуке Шимизу посещают святыню Королевского Семейства Азуми в Окинаве. Нами, молодой предсказательнице, было видение, что монстр уничтожит мир. Мазахико посещает пещеру и находит странный кусок металла. Он показывает его Профессору Мияджиме, который говорит, что это космический титан. Тем временем, в другой пещере, Кейзуке и археолог Саеко находят маленькую статую древнего мифологического существа по имени Царь Сизар. Саеко переводит пророчества в старом иероглифическом письме на статуе и читает, о том, что когда черная гора появится в небе, то явится монстр и станет рушить мир. Когда поднимется солнце на западе, появятся два монстра, чтобы спасать людей. Саеко улетает, чтобы встретиться с Профессором Уогером. Саеко неожиданно встречает Кейзуке. В то время как они говорят про статую, темный человек, называющий себя "скандальный охотник, " утверждая о том, что знает Уогера, прерывает их беседу. Внезапно темное облако в форме горы появляется в небе. Пророчество уже осуществляется! Когда Саеко достигает дома Уогера, он удивленно узнает, что он - дядя Кейзуке. При чтении книги, Уогер внезапно бросает свое занятие и пытается украсть статую, но терпит неудачу. Внезапно случилось землетрясение и появился странно ревущий Годзилла. Монстр идет по Земле, разрушая все на своем пути. Уогер и Саеко думают, что это должно быть монстр Судного Дня из пророчества, но Саеко говорит, что он никогда не предположил бы, что этот монстр Годзилла. Вскоре появляется Ангирус, который начинает бороться с Годзиллой. Идя к месту действия, Кейзуке восклицает, что События идут неправильно. Ангирус не должен нападать на своего друга Годзиллу. Борьба заканчивается быстро, когда Годзилла вырывает кишки из тела Ангируса. Монстр, в приступе боли отступает. Кейзуке находит большой кусок космического титана на месте сражения. Годзилла идет к заводу по очистке нефти и уничтожает его. В это время Профессор Мияджима, его дочь Ико, и Мазахико видят,что другой Годзилла выходит из моря. Он начинает бороться с другим Годзиллой , который напал на Ангируса. Металлический Годзилла, названный Меха-Годзиллой, сильно ранит Годзиллу, и король монстров вынужден уйти в океан. Меха-Годзилла, все равно, тоже подвергается серьезному ущербу и также вынужден отступить. Вскоре становится ясно, что Меха-Годзилла создан иностранной расой, названной Саймонами. Они изучали Годзиллу много лет и решили создать свою собственную механическую версию, чтобы захватить Землю. Человек, который хотел украсть статую Царя Сизара, был одним из них. Саймоны захватывают Мияджиму, Ико и Мазахико и шантажируют Мияджиму, чтобы он восстановил Меха-Годзиллу. Кейзуке и Саеко волнуются, так как Мияджима не возвращается домой уже много дней. В это время в пещере, Кейзуке и Саеко встречают Саймона. Саймона застрелил Агент Интерпола. Главные герои прорываются на базу Саймонов и спасают Мияджиму, Ико и Мазахико. Кейзуке, Ико и Саеко мчатся со статуей Царя Сизара к Замку Азуми, в то время как Мияджима и Агент Интерпола бегут назад на базу, чтобы уничтожить Мегагодзиллу. Они замечают, что луна краснеет, согласно пророчеству. Прежде, чем Мияджима и агент Интерпола уничтожают Меха-Годзиллу, Саймоны запускают его. Герои пытаются бежать с базы, но Саймоны их возвращают. В Замке Азуми, Ико и Кейзуке обнаруживают что солнце восходит на западе и понимают, что это - мираж. Они размещают статую Сизара в храме, и гора открывается, а внутри нее - спящее животное. Предсказательница Азуми поет ритуальную песню и пробуждает Царя Сизара. Прилетает Меха-Годзилла и борется с Сизаром, который не совсем отошел от сна. Прежде чем Меха-Годзилла делает заключительный удар, приплывает Годзилла и борется против механического клона. Годзилла превращает свое тело в сильное магнитное поле и уничтожает Меха-Годзиллу. Мияджима и агент Интерпола бегут с базы. Мир спасен.